داستان بازی همان روایت تراژیک و سنگین نسخه اصلی است. جیمز ساندرلند نامهای از همسر فوتشدهاش، مری، دریافت میکند که از او میخواهد به شهر Silent Hill بیاید. از همین جا، سفری تاریک و پرابهام آغاز میشود که در آن، جیمز با هیولاهایی که تجلی گناهان و احساسات سرکوبشدهاش هستند، روبهرو میشود.